墨子的学问才可以称得上真正的学科。墨子的哲学建树，以认识论和逻辑学最为突出，其贡献是先秦其他诸子所无法企及的。墨子的逻辑学墨辩、印度的因明学与古希腊的亚里士多德逻辑，并称世界三大古典逻辑。他比较自觉地、大量地运用了逻辑推论的方法，以建立或论证自己的政治、伦理思想。
他还在中国逻辑史上第一次提出了辩、类、故等逻辑概念。并要求将辩作为一种专门知识来学习。墨子的“辩”虽然统指辩论技术，但却是建立在知类（事物之类）明故（根据、理由）基础上的，因而属于逻辑类推或论证的范畴。墨子所说的“三表”既是言谈的思想标准，也包含有推理论证的因素。墨家灭绝，导致中国二千多年时间里缺乏逻辑学，只会顶着圣人的头衔，学着圣人之言，不会表达，不会讲理。可以说是中国人的悲哀。
墨子的认识论在今天看来仍然是十分有效的认识论。怎样判定一个事理的正确性？他以“耳目之实”的直接感觉经验为认识的唯一来源，他认为，判断事物的有与无，不能凭个人的臆想，而要以大家所看到的和所听到的为依据。墨子从这一朴素唯物主义经验论出发，提出了检验认识真伪的标准，即三表：“上本之于古者圣王之事”，“下原察百姓耳目之实”，“废（发）以为刑政，观其中国家百姓人民之利”。
墨子所说的“说知”，包含有推理、考证的意思，指由推论而得到的知识。他特别强调“闻所不知若已知，则两知之”，即由已知的知识去推知未知的知识。如已知火是热的，推知所有的火都是热的；圆可用圆规画出，推知所有的圆都可用圆规度量。由此可见，墨子的闻知和说知不是消极简单地承受，而是蕴涵着积极的进取精神。
除闻知和说知外，墨子非常重视亲知，这也是墨子与先秦其他诸子的一个重大不同之处。墨子所说的亲知，乃是自身亲历所得到的知识。他把亲知的过程分为“虑”、“接”、“明”三个步骤。
“虑”是人的认识能力求知的状态，即生心动念之始，以心趣境，有所求索。但仅仅思虑却未必能得到知识，譬如张眼睨视外物，未必能认识到外物的真象。
因而要“接”知，让眼、耳、鼻、舌、身等感觉器官去与外物相接触，以感知外物的外部性质和形状。而“接”知得到的仍然是很不完全的知识，它所得到的只能是事物的表观知识，且有些事物，如时间，是感官所不能感受到的。因此，人由感官得到的知识还是初步的，不完全的，还必须把得到的知识加以综合、整理、分析和推论，方能达到“明”知的境界。总之，墨子把知识来源的三个方面有机地联系在一起，在认识论领域中独树一帜。
另外，墨子还在数学、几何、物理、光学、声学、机械制造等等方面都有自己独特的研究与贡献，即使在当时整个人类社会都是比较先进的。但是，这些在现实生活中非常有实用价值的科学技术，在孔子儒家看来，只是器具的层面，即孔子所谓的“君子不器”，在儒术独尊之后，自然是被社会歧视的对象。
墨子之所以会灭绝，其实正是儒法结合的结果，儒家满口仁义道德，法家讲究阴谋、阳谋控制术。这些东西都与墨家思想格格不入。无论政治思想，制度设置，核心价值观，还是研究的范围，墨家的思想都远远超出了当时的诸子百家。老子的《道德经》虽然