意外的风云变幻是在云南清驻军中最大的金声桓、李成栋两部人马叛变了。二人之所以会在这时候如历史上一样反叛乃是出于同样的原因，所以其它因素的改变不会改变二人的反叛之心，反而因历史改变使两人反叛时间提前了一些。
说到历史上两人及其他一些人会投降、会此时反判，主要是当时满清与吴三桂合作干脆利落打败了李自成，而李自成当时已经成势，官军已经无力阻挡了。
就是这样一支强军被满清打败后被千里追杀，况清军与明军在辽东打了十几年有挫胜仗多，唯能抗敌唯有辽东铁骑，等辽东铁骑与清军合为一伙，剩下的明军一是恐惧，二是知道其他将领靠不住，于是金声桓随左良玉、李成栋高杰被暗杀后都投降了满清。
在这时失败主义占据绝大多数将领的思想，所以左良玉、刘泽清等人干脆投降，不愿投降的高杰、黄得功、白旺等人都被暗杀了。
在恐惧与如大山倾倒之势压力下明军、义军直接投降的成风，但历史上清军下江南后也是锐气大减，实际上与李自成进京城后表现差不多，区别只是李自成碰上吴三桂勾结满清，仓促作战刚塑造的不败金身被这两家联手打破了，清军十几年塑起的不败金身却没有其他力量打破。
可清军的不败神话在江南渐渐褪色，反而在江南对付南明军队、李自成残余部队、大西军残部上立下大功的金声桓、李成栋觉得没有受到相应的嘉奖与待遇，反而受到满人、文官的欺侮。
在这样的情形下历史上这些人忍无可忍中反叛了满清，这些人历史上如此情形下愤然反清的。这些情形在此时也一样存在，如清军比历史上更加脆弱，在讨好汉人上比历史上虽然步子与力度更大一点，但享受这些好处的主要是文臣。
武将方面左良玉、刘泽清、刘良佐等人虽被封了王，但直接兵权却是被架空。如左良玉手下金声桓等都独掌一军。而金声桓、李成栋等虽封了伯侯，职为提督，后勤仍旧如大明一样却受低级文官制压，另外还有满人高官指挥，所以名为高官也不自由。
满清落毛凤凰不如鸡，却不能完全放下架子仍然搞满人为尊，另外大明的好东西不学将以文制武学会了，如此行为让那些武将怎么甘心情愿。
以往满八旗威势尚在还好，看到护卫队已经完全占领了长江以北及四川，满清为防备护卫队在军事上捉襟见肘颓势己显，金声桓、李成栋他们提前发难可以理解。
加上清军为与护卫队决战，在兵力上比历史同期更庞大，地盘却是更，致使发生与明军同样的军饷克扣、拖延，造成士气不振。
由于清军状况不及历史，金声桓、李成栋两人反叛带动了其他人的反正。这一来清军留在云南二十万多军队略多于联军，一下叛变了十万多，造成多个城市变色兵力上大窟窿外，还造成了清军内部互相猜忌，及严重的失去坚守的勇气。
正是如此在云南的剩余清军不敢坚守，纷纷逃离原来守卫的城市向后退却。这样做很好理解，因为兵力优势失去被包围了就是断绝外援迟早失败的下场了。
另外由于矛盾积累已深，属于突然喷发，还因形势与历史上有较大的改变这场大叛变第一是杀性重，如历史上李成栋没有杀总督佟养甲，这时将满人高官全杀了。
除果断杀人外这次反叛还行动迅速，并与联军有些配合，一发动才三五日清军的布置已经成为一盘散沙，不跟着反叛的也先逃为妙，逃慢一点不是也跟随反叛就是被消灭了。