就在李定国征粮的这段日子里，各地又陆续有义军来投，其中实力最强的，当属原本活跃在钦州龙门岛一带的原明靖氛将军邓耀所率五千舟师。
李定国算了一下征集的物资，虽说未必尽够大战之需，但估计当地百姓已经已基倾其所有了，便只得打住。再一算自己的人马，除了自己的本部外，各地来投的义军和已经跟他约好在新会接应他的水陆部众，已超出了十万之众。
时间已到了徐少卿该回来的日子，可谁知他也和以前的使者一样，也是泥牛入海，音讯渺茫。不过此时李定国心中已有了些底气，觉得凭借自己手里的人马和物资也可以和新会清军放手一搏了，再者，他现在无疑已是箭在弦上，他深知此役事关大明前途，成败在此一举，无论有没有郑军配合，他都别无选择。
正当他准备亲率大军，全力出征新会之际，谁知老天爷好像要故意跟他作对，他竟然生病了。
大约因为操劳忧心过度，他这一病可病得不轻，上吐下泻，中脘穴一带疼痛不止。
好在军中有名医陈舜相随，每日服药用针，病情总算得到控制，不过也是时好时歹，要上战场暂时是不可能的了。
于是他只得继续住在高州，一边养病，一边遥控指挥前方战事。
却说新会城里守军，原也不过两万来人马。清军守将打探得李定国大军来攻，也曾向广州求救。尚可喜和耿继茂二藩王虽明知新会乃广州的重要门户，新会的存亡直接关系到广州的安全，却不敢擅自带兵增援，怕李定国乘势端他老巢，从而使自己重蹈孔有德的覆辙，于是一边死守广州，一边向清廷求援，同时派出得力手下参将由云龙和右翼总兵吴进忠进驻新会协同防守。尚可喜可是给这二人下了死命令：人在城在，人不在城还在。若是人在城不在，提头来见！
这座新会城的城池，最早筑于元代，当时的城墙是用土坯夯成，到了明初洪武年间，千户宋斌改用青砖砌筑，称为“旧城“。后来随着城市的发展以及防备海寇侵扰的需要，分别于成化十年和万历元年由当地官府主持，发动乡绅捐资修筑了“子城”和“新城”。这样，该城的新旧两城周围共1370丈，建有城门7座，便门4座，大水关3座，小水关2座，在广东属于仅次于广州和潮州两大府城的第三大城池。
吴子圣和王兴的兵马一到新会，便即展开攻城，刚开始是用的炮轰，由于该城的青砖城墙极为坚固，吴子圣带来的大炮里只有两门红夷大炮威力稍大，其余皆是自制的土炮，根本对城墙造不成实质性的损坏，而城墙上的清兵也架起大炮和明军对轰，反而给明军造成较大的杀伤。后又改用搭云梯和挖地道，也给久经沙场的由云龙和吴进忠带领众清兵一一破解。
吴子圣攻城三月，新会城依然坚如磐石。反倒是后一步到来的陈奇策和邓耀所部水师建了奇功。
就在吴子圣和王兴部久攻新会不下之时，凌海将军陈奇策果不爽约，率领近万舟师赶来接应了。他们从上川岛出发，将百余余艘战船泊于潭江的入海口，随即派人到新会告诉了吴子圣，吴子圣